跨祖先全基因組關聯研究--揭示了肺癌的新遺傳風險因素
近日,《Nature Genetics》發(fā)表了一篇由貝勒醫(yī)學院(Baylor College of Medicine)進行的研究“Cross-ancestry genome-wide meta-analysis of 61,047 cases and 947,237 controls identifies new susceptibility loci contributing to lung cancer”,確定了肺癌的新遺傳風險因素。
研究背景
“肺癌風險影響所有人群。歐洲血統(tǒng)人群中的風險因素已被廣泛研究,但科學家在識別影響非洲和亞洲血統(tǒng)人群的遺傳風險因素方面進展較慢。”臨床和轉化醫(yī)學研究所所長,醫(yī)學教授兼流行病學和人口科學臨時科長Chris Amos博士說,“通過研究不同的人群,我們才可以更好地了解人群之間不同的風險因素,以及人群之間共享的風險因素如何以不同的方式影響不同的人?!?/span>
數據對照與遺傳變異影響
為了在不同的人群中鑒定新的肺癌易感位點,團隊分析了來自61,000多名肺癌患者和近100萬研究對照組的數據。通過跨祖先全基因組關聯研究,發(fā)現了五個以前未報道的位點。然后,研究人員復制了26個信號,從先前報道的位點中再次確定了10個新的先導關聯。
與此同時,研究發(fā)現,罕見變異關聯往往出現于特定人群。甚至一些已知的風險因素,如影響吸煙行為的CHRNA5和CYP2A6基因,也被發(fā)現顯示出群體特異性。數據顯示,易感性候選基因通常是涉及免疫應答和細胞應激反應的生物學途徑的一部分。該研究中發(fā)現的一個值得注意的易感基因候選者是IRF4,已知它會導致黑色素瘤,并在這里首次確定其與肺癌風險有關。
研究意義
研究人員還對肺成纖維細胞中的易感基因進行了功能測定,發(fā)現包括IRF4在內的許多這些基因在上調時會促進DNA損傷。這種機制可能對未來的肺癌治療研究很重要?!按龠MDNA損傷的基因可能是PARP抑制劑治療的良好靶向候選者,它可以防止癌細胞修復某些類型的DNA損傷?!必惱沾髮W的博士后助理Jun Xia說,“這些基因在研究對免疫療法的反應中可能也很重要,因為免疫療法往往在具有高突變負擔的腫瘤中效果較好。
“在未來,我們的研究結果可能有助于識別患肺癌風險較高的人?!必惱沾髮W流行病學和人口科學醫(yī)學助理教授Jinyoung Byun博士說,“我們希望更好地了解遺傳信息如何幫助人們改變他們的行為,以降低患肺癌的風險?!?/span>
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