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  北京協(xié)和團(tuán)隊(duì)發(fā)現(xiàn)肝癌檢測(cè)的甲基化液體活檢方法
  
  2022-12-01 來(lái)源：轉(zhuǎn)化醫(yī)學(xué)網(wǎng)
  
  近日，發(fā)表在《Science Translational Medicine》上的文章“Simultaneous analysis of mutations and methylations in circulating cell-free DNA for hepatocellular carcinoma detection”，報(bào)道了一項(xiàng)由北京協(xié)和醫(yī)院研究團(tuán)隊(duì)開(kāi)發(fā)的新技術(shù)——Mutation Capsule Plus (MCP) 技術(shù)，該技術(shù)允許對(duì)來(lái)自肝細(xì)胞癌患者的單個(gè) cfDNA 樣本進(jìn)行突變和甲基化變化的平行分析，包括同時(shí)檢測(cè)遺傳和表觀遺傳改變以及甲基化標(biāo)記的全基因組發(fā)現(xiàn)。
  
  研究背景
  
  肝細(xì)胞癌 (HCC) 是全球第五大常見(jiàn)癌癥和第三大致命癌癥。晚期肝細(xì)胞癌的 5 年生存率僅為 12%，因?yàn)榭捎茂煼ǖ寞熜в邢?。治愈這種疾病有效的方法是在早期發(fā)現(xiàn)它，以便及時(shí)通過(guò)手術(shù)切除腫瘤。因此，需要一種在手術(shù)可切除階段以高精度檢測(cè)肝細(xì)胞癌的有效篩查方法。
  
  先前，已有多項(xiàng)研究證實(shí)了使用液體活檢進(jìn)行突變檢測(cè)的可行性。然而，由于采樣問(wèn)題，檢測(cè)低產(chǎn)量 cfDNA 中的低頻突變可能很困難。
  
  新技術(shù)
  
  為了解決這個(gè)問(wèn)題，研究人員開(kāi)發(fā)了 Mutation Capsule Plus (MCP) 技術(shù)，支持突變和甲基化變化的并行分析（MCP 分析）以及通過(guò) CpG 串聯(lián)靶擴(kuò)增從頭發(fā)現(xiàn)甲基化標(biāo)記。MCP 技術(shù)還可以在不犧牲靈敏度的情況下對(duì)單個(gè) cfDNA 樣本進(jìn)行多重測(cè)試，這在將 cfDNA 樣本拆分為多個(gè)反應(yīng)時(shí)可能會(huì)發(fā)生。研究人員將 MCP 技術(shù)應(yīng)用于發(fā)現(xiàn)、訓(xùn)練和驗(yàn)證用于檢測(cè) HCC 的液體活檢分析。這種全面的分析方法允許比較基于 cfDNA 的生物標(biāo)志物，揭示用于 HCC 檢測(cè)的甲基化和突變生物標(biāo)志物的互補(bǔ)模式。
  
  利用這項(xiàng)技術(shù)，研究人員對(duì)來(lái)自 30 例肝細(xì)胞癌 (HCC) 病例和 30 例非 HCC 對(duì)照的 cfDNA 樣本進(jìn)行了甲基化標(biāo)記物的從頭篩選。在 60 個(gè) HCC 和 60 個(gè)非 HCC 病例的訓(xùn)練隊(duì)列中，進(jìn)一步平行分析富含 HCC cfDNA 的甲基化標(biāo)記物和一組突變，從而產(chǎn)生 HCC 檢測(cè)模型。研究人員在包含 58 例 HCC 和 198 例非 HCC 病例的獨(dú)立回顧性隊(duì)列中驗(yàn)證了該模型，獲得了 90% 的敏感性和 94% 的特異性。此外，研究人員將該模型應(yīng)用于 311 名肝臟超聲檢查和血清 AFP 濃度正常的無(wú)癥狀乙型肝炎病毒攜帶者的前瞻性隊(duì)列。該模型檢測(cè)了隊(duì)列中 5 個(gè) HCC 病例中的 4 個(gè)，顯示出 80% 的敏感性和 94% 的特異性。
  
  這些發(fā)現(xiàn)表明，MCP 技術(shù)具有發(fā)現(xiàn)和驗(yàn)證用于癌癥無(wú)創(chuàng)檢測(cè)的多組學(xué)生物標(biāo)志物的潛力。該研究還提供了一個(gè)綜合數(shù)據(jù)庫(kù)，其中包含大量 HCC 病例和高危非 HCC 個(gè)體的 cfDNA 的遺傳和表觀遺傳改變。
  
  研究意義
  
  總之，研究人員開(kāi)發(fā)了一種支持對(duì)單個(gè) cfDNA 樣本進(jìn)行多重測(cè)試的技術(shù)，用于發(fā)現(xiàn)或分析與突變并行的甲基化變化。與目前使用的其他檢測(cè)方法或單獨(dú)評(píng)估甲基化或突變標(biāo)記物相比，MCP 技術(shù)能夠幫助開(kāi)發(fā)具有強(qiáng)大性能的 HCC 液體活檢檢測(cè)方法。該技術(shù)和策略，包括新甲基化標(biāo)記物的鑒定以及突變和甲基化的組合分析，可用于開(kāi)發(fā)其他腫瘤類型的液體活檢分析。由于多重測(cè)試功能，一項(xiàng)研究中的前 MCP 文庫(kù)可用于未來(lái)的研究，以分析其他腫瘤類型或多種腫瘤類型的不同生物標(biāo)志物組。
  
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