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  郭衛(wèi)剛團隊：揭示食管鱗狀細胞癌的預(yù)后建模和新興治療靶點
  
  2024-09-24 來源：轉(zhuǎn)化醫(yī)學網(wǎng)
  
  2024年9月20日，復(fù)旦大學附屬中山醫(yī)院郭衛(wèi)剛團隊在期刊《Heliyon》上發(fā)表了題為“Prognostic Modeling and Emerging Therapeutic Targets Unveiled through Single-Cell Sequencing in Esophageal Squamous Cell Carcinoma”的研究論文。這項研究整合了單細胞測序和復(fù)雜的計算技術(shù)，以突出IGFBP2作為ESCC中一個有前途的生物標志物和治療靶點。
  
  研究背景
  
  食管癌是一項重大的全球健康挑戰(zhàn)，2022年報告了約510,716例新病例，使其成為全球第11大普遍的癌癥，占當年所有癌癥診斷的2.6%。2022年，約有445,129人死于食道癌，使其成為癌癥相關(guān)死亡的第7大原因，占所有癌癥死亡人數(shù)的4.6%。其中，鱗狀細胞癌（SCC）是主要亞型，占所有食管癌病例的85%。
  
  傳統(tǒng)的RNA-seq技術(shù)只能在聚集樣本水平上分析腫瘤，限制了對腫瘤細胞細胞多樣性和分子復(fù)雜性的探索。近年來，單細胞測序技術(shù)的出現(xiàn)，提供了一種變革性的方法。該方法能夠在單個細胞水平上，表征不同細胞類型的表型和生物學行為，并有望確定潛在的治療靶點。
  
  在這項研究中，團隊通過使用來自ESCC的單細胞RNA 測序（scRNA-seq）數(shù)據(jù)，分析癌細胞和非癌細胞類型，來鑒定癌細胞中獨特表達的基因。此外，團隊開發(fā)了一個帶有評分系統(tǒng)的基因預(yù)測模型，以提高在scRNA-seq數(shù)據(jù)集中，檢測單個癌細胞的準確性，從而增強科學界分離癌細胞，進行深入分析的能力。
  
  研究進展
  
  IGFBP2的臨床意義
  
  與鄰近食管組織相比，IGFBP2在腫瘤樣本中顯著過表達，這與團隊的scRNA-seq結(jié)果一致。為了確定IGFBP2的臨床意義，團隊進行了Kaplan-Meier生存分析。結(jié)果顯示，與低表達水平的患者相比，表現(xiàn)出高IGFBP2染色強度的患者與較差的預(yù)后相關(guān)。此外，多變量Cox分析顯示，在考慮年齡、性別和分期后，IGFBP2的表達仍然是OS的獨立預(yù)后因素。
  
  IGFBP2的臨床意義。
  
  與IGFBP2相關(guān)的免疫特性
  
  團隊發(fā)現(xiàn)，IGFBP2表達與許多腫瘤相關(guān)免疫細胞（尤其是CD8+ T細胞）的浸潤之間，存在顯著的負相關(guān)。此外，團隊觀察到IGFBP2表達升高與多種免疫調(diào)節(jié)劑的下調(diào)有關(guān)，包括抗原呈遞、共刺激、T細胞效應(yīng)功能和免疫檢查點。這表明IGFBP2在ESCC中具有潛在的免疫抑制作用。
  
  IGFBP2的免疫相關(guān)特征。
  
  研究結(jié)論
  
  這項研究發(fā)現(xiàn)了幾個在傳統(tǒng)批量數(shù)據(jù)分析中，不容易檢測到的腫瘤相關(guān)基因。這一成就在很大程度上歸功于scRNA-seq技術(shù)的利用。鑒于癌細胞通常只占這種混合物的一小部分，因此在使用大量RNA測序時，腫瘤特異性標志物可能會因其低豐度而黯然失色。相比之下，單細胞測序技術(shù)為深入研究單個細胞類型的表達模式提供了強大的工具，這使得科學界能夠揭示錯綜復(fù)雜的細胞異質(zhì)性和新的治療靶點，否則，這些靶點將無法通過批量分析獲得。用特定藥物靶向這些基因，可以通過較大限度地減少對非惡性細胞的毒性影響，來提供更安全、更有效的治療策略。這強調(diào)了了解ESCC分子景觀，對于開發(fā)靶向治療和改善患者預(yù)后的重要性。
  
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