9月25日，華中科技大學(xué)與深圳華大生命科學(xué)研究院、國(guó)家婦產(chǎn)疾病臨床醫(yī)學(xué)研究中心以及江南大學(xué)的研究人員合作在期刊《Advanced Science》上發(fā)表了題為“Plasma Cell-Free DNA Concentration and Fragmentomes Predict Neoadjuvant Chemotherapy Response in Cervical Cancer Patients”的研究論文，本研究中，研究人員分析了84例宮頸癌患者的285份血漿游離DNA（cfDNA）樣本的濃度，并探討了新輔助化療（NACT）治療期間cfDNA片段組學(xué)特征的臨床意義。與有良好響應(yīng)的患者相比，對(duì)NACT治療有不良響應(yīng)的患者在初始治療周期后的cfDNA水平顯著升高。在初始血漿中觀察到具有不同NACT響應(yīng)的患者之間cfDNA端位譜和啟動(dòng)子覆蓋的不同特征。值得注意的是，DNASE1L3分析進(jìn)一步證明了cfDNA特征與化療抵抗之間的內(nèi)在聯(lián)系。此外，啟動(dòng)子周?chē)霓D(zhuǎn)錄起始位點(diǎn)（TSS）覆蓋揭示了與化療抵抗相關(guān)的生物學(xué)過(guò)程的改變，并反映了預(yù)測(cè)化療響應(yīng)潛力的價(jià)值。這些預(yù)測(cè)性生物標(biāo)志物的研究成果可以優(yōu)化宮頸癌患者的治療選擇，減少不必要的治療，并有助于制定個(gè)性化的治療策略。
已經(jīng)證明，DNASE1L3在血漿cfDNA的降解和帶有C端的cfDNA的產(chǎn)生中發(fā)揮著重要作用。研究人員使用ELISA法測(cè)量了8例宮頸癌患者初始血漿中的DNASE1L3水平（如圖2a所示）。cfDNA分子的C端比例與DNASE1L3水平呈顯著正相關(guān)（Spearman r = 0.738, p = 0.046）。血漿中cfDNA的A/T/G片段頻率與DNASE1L3水平無(wú)顯著相關(guān)性。這一觀察結(jié)果證實(shí)了DNASE1L3在塑造人類(lèi)cfDNA特征方面的作用。考慮到非響應(yīng)者中以“C”開(kāi)頭的模式有顯著下調(diào)，研究人員進(jìn)一步探索了DNASE1L3在宮頸癌中的表達(dá)及其對(duì)化療敏感性和腫瘤進(jìn)展的影響。使用組織芯片（TMA）評(píng)估了DNASE1L3在腫瘤（n = 99）和正常（n = 17）宮頸組織中的表達(dá)及其預(yù)后意義（見(jiàn)實(shí)驗(yàn)部分）。圖2b展示了腫瘤和正常宮頸組織中DNASE1L3表達(dá)的代表性免疫組織化學(xué)染色結(jié)果。根據(jù)圖2c，腫瘤組織的DNASE1L3 IHC評(píng)分顯著低于正常組織（中位數(shù)：2.0 vs 4.5，p值<0.0001），表明腫瘤組織中DNASE1L3表達(dá)水平顯著降低。研究人員進(jìn)一步分析了TCGA數(shù)據(jù)庫(kù)中306例宮頸癌患者的腫瘤組織和22例正常宮頸組織的轉(zhuǎn)錄組數(shù)據(jù)。結(jié)果顯示，與正常宮頸樣本相比，宮頸癌樣本中DNASE1L3表達(dá)同樣顯著降低，這表明DNASE1L3的失調(diào)可能在宮頸癌的發(fā)展和進(jìn)展中發(fā)揮作用。
