美國國家癌癥研究所(NCI)資助的一項新研究表明:罕見癌癥“胃腸道間質(zhì)瘤(GISTs)”的病因可能已被找到。不過,罪魁禍首并非有害的基因突變(這是癌癥的典型特征),而是與突變無關(guān)的基因變化,即所謂的表觀遺傳變化。
多年來,癌癥研究人員一直在研究表觀遺傳學。但是表觀遺傳領(lǐng)域仍然存在許多問題,其中之一就是:將表觀遺傳異常與特定疾病聯(lián)系起來的潛在機制是什么?而由哈佛醫(yī)學院麻省總院布拉德利·伯恩斯坦(Bradley Bernstein)博士領(lǐng)導的這項研究,是為數(shù)不多的將一種非常特殊的表觀遺傳變化確定為癌癥病因的研究之一。
盡管絕大多數(shù)胃腸道間質(zhì)瘤(GISTs)是由兩種致癌基因(KIT和PDGFRA)突變引起的,但有將近10%的GIST腫瘤缺乏這些突變。而這些缺乏KIT和PDGFRA突變(也稱為野生型GIST)的腫瘤大多具有遺傳或表觀遺傳改變,導致一種名為SDH的蛋白質(zhì)的丟失。
幾年前,NCI的研究人員發(fā)現(xiàn),缺乏SDH的GIST表現(xiàn)為廣泛的表觀遺傳變化,但尚不清楚這些變化是否會導致腫瘤生長,以及如何導致腫瘤生長。
三維DNA景觀
你可能不敢相信,每個人類細胞的細胞核有大約6英尺(約合1.8米)的DNA。為了實現(xiàn),DNA被纏繞、編織、折疊成緊湊的結(jié)構(gòu),就像一堆糾纏在一起的紗線。但DNA并不是隨意散布在細胞核周圍的,而是被精心安排成一個精準的三維“景觀”,DNA的每一部分都被放置在其中一個特定的位置。
這種精準的分布有助于控制哪些基因何時被激活。例如,DNA可以被折疊成環(huán)狀,將某些基因與附近的“開啟開關(guān)”分離開來?!伴_啟開關(guān)”是DNA的一部分,它會使基因超速運轉(zhuǎn),即使它們產(chǎn)生更多的蛋白質(zhì)。
伯恩斯坦博士解釋道,表觀遺傳改變可以改變DNA的折疊方式,從而影響哪些基因被打開和關(guān)閉。這些改變在一定程度上是導致血細胞與神經(jīng)細胞不同的原因,盡管它們擁有完全相同的一組基因。
在這項新的研究中,研究者們證實了表觀遺傳改變確實會導致SDH缺陷GIST的生長。
具體而言,他們發(fā)現(xiàn),在缺乏SDH的GIST腫瘤中,被稱為DNA甲基化的表觀遺傳變化取代了數(shù)百個DNA“錨”。伯恩斯坦博士解釋說,錨在相鄰的DNA環(huán)之間創(chuàng)造了物理邊界,就像兩個鞋帶環(huán)之間的結(jié)一樣。
一些被取代的錨點位于包含癌基因FGF3、FGF4和KIT的環(huán)路附近。而沒有了錨點,致癌基因就能夠與鄰近回路的開啟開關(guān)相互作用。
“在正常情況下,錨點保護致癌基因不受另一個回路的開啟。但DNA甲基化破壞了錨點,導致環(huán)融合成一個?!辈魉固共┦空f。
結(jié)果所有這三個基因都被激活,并產(chǎn)生了高水平的蛋白質(zhì)。相比之下,KIT-或pdgfr突變GIST患者腫瘤中的FGF3和FGF4蛋白水平較低或未檢測到。
“這些發(fā)現(xiàn)表明,即使沒有突變,致癌基因仍然可以被有效激活?!辈魉固共┦空f。
治療的新機會?
那么,靶向KIT和FGF的藥物是否可以阻止SDH-缺陷GIST的生長?為此,研究者們用來自SDH-缺陷GIST的患者的腫瘤樣本建立了一個小鼠模型進行實驗。
實驗結(jié)果顯示:用舒尼替尼(一種阻斷KIT和其他蛋白質(zhì)的藥物)治療小鼠對腫瘤生長的影響很小。但用Infigratinib治療,一種阻止FGFR(與FGF相互作用的蛋白質(zhì))的實驗藥物,可以顯著減緩腫瘤的生長。
研究人員發(fā)現(xiàn),聯(lián)合使用舒尼替尼和伊夫替尼治療小鼠甚至更有效,甚至在停止治療后,也比單獨使用這兩種藥物更能在更大程度上和更長的時間內(nèi)抑制腫瘤生長。
伯恩斯坦博士團隊目前正與NCI的臨床治療評估項目合作,計劃啟動一項針對SDH缺陷GIST患者的Infigratinib臨床試驗。他們希望進一步驗證這種新的聯(lián)合療法。
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