AI識別腦膠質(zhì)瘤基因突變 準確率超97%
膠質(zhì)瘤是顱內(nèi)常見、預(yù)后差的原發(fā)惡性腫瘤,目前仍缺乏有效治療手段。隨著分子生物學(xué)技術(shù)的快速發(fā)展,膠質(zhì)瘤個性化診斷和精準治療迎來了新希望。
近日,德克薩斯大學(xué)西南醫(yī)學(xué)中心(UT Southwestern)的一項新研究表明,人工智能可以僅通過檢查大腦的3D圖像來識別腦膠質(zhì)瘤中的特定基因突變,其準確率超過97%。
腦膠質(zhì)瘤是常見的惡性原發(fā)性腦瘤,占所有惡性腦瘤的3/4。盡管具有IDH酶突變的腫瘤通常預(yù)后較好,但高級別腦膠質(zhì)瘤(HGG)仍是“致命殺手”,五年生存率僅為15%。
近年來,美國各地的科學(xué)家也一直在測試其他成像技術(shù)。而這項新的研究介紹了一種準確且臨床可行的方法,有望被廣泛用于改變腦瘤的診斷模式。
在常規(guī)外科手術(shù)中,需要采集并分析膠質(zhì)瘤樣本來選擇合適的治療方法,而這項AI技術(shù)可能會免于外科手術(shù)預(yù)處理的常規(guī)做法。未來幾年中,腦瘤患者可能無需動刀就能確定其腫瘤的較好治療方法。
IDH突變酶膠質(zhì)瘤的分子標志物及所涉及的信號通路有很多,比如:異檸檬酸脫氫酶(IDH)突變、EGFR擴增、H3F3A突變、Notch通路、miRNAs等。這些標志物及信號轉(zhuǎn)導(dǎo)通路參與了膠質(zhì)瘤的發(fā)生、發(fā)展,對膠質(zhì)瘤的增殖、轉(zhuǎn)移、侵襲等具有明顯影響。
在該研究中,研究人員使用深度學(xué)習(xí)網(wǎng)絡(luò)和標準磁共振成像(MRI)來檢測異檸檬酸脫氫酶(IDH)的基因的狀態(tài),這種基因產(chǎn)生的一種突變形式的酶,可能會引發(fā)腦瘤的生長。
一般來說,治療膠質(zhì)瘤首先通過手術(shù)來獲取腫瘤組織,然后對其進行分析以確定IDH突變狀態(tài)。根據(jù)患者的神經(jīng)膠質(zhì)瘤是否有IDH突變,預(yù)后和治療方案會有所不同。
但是,臨床上想獲取足夠的腫瘤組織樣本比較耗時,且有一定的風(fēng)險。因此,研究人員一直在研究如何通過非手術(shù)的方法來確定IDH的突變狀態(tài)。
一旦了解到神經(jīng)膠質(zhì)瘤的特定突變狀態(tài),對確定患者的預(yù)后和治療策略都有重要幫助。如果能僅使用常規(guī)影像和AI就能確定這種突變狀態(tài),臨床治療將迎來巨大的飛躍。
腫瘤成像分析
為改善檢測IDH突變的過程和決定適當?shù)闹委煼椒?,約瑟夫·馬爾吉安(Joseph Maldjian)博士團隊開發(fā)了兩個深度學(xué)習(xí)網(wǎng)絡(luò),一個網(wǎng)絡(luò)僅使用MRI中的一個系列(T2加權(quán)圖像),而另一個網(wǎng)絡(luò)則使用MRI中的多個圖像類型,然后分析了來自美國200多名腦癌患者的公共數(shù)據(jù)庫中的影像數(shù)據(jù)。
結(jié)果顯示,這兩個深度學(xué)習(xí)網(wǎng)絡(luò)的準確性幾乎一樣,這表明僅使用T2加權(quán)圖像可以大大簡化IDH突變的檢測過程。不管是化療、放療,還是手術(shù)切除腫瘤,IDH突變狀態(tài)的檢測可以幫助醫(yī)生確定適合患者的治療方案。
這項研究于今年春季發(fā)表在《神經(jīng)腫瘤學(xué)》((Neuro-Oncology)雜志上,與以往研究有所不同的是:
·該方法準確度高。以前的技術(shù)常常無法達到90%的準確率。
·突變狀態(tài)是通過分析單個系列的MR圖像(而不是多種圖像類型)來確定的。
·需要一種算法來評估腫瘤中的IDH突變狀態(tài)。其他技術(shù)需要額外的深度學(xué)習(xí)模型,首先確定腫瘤的邊界,然后檢測潛在的突變。
這種新的深度學(xué)習(xí)模型的優(yōu)點在于其簡單便捷性和高度準確性,而類似的方法也可以用于識別其他癌癥的重要分子標記。
IDH抑制劑+AI影像技術(shù)
通過AI深度學(xué)習(xí)網(wǎng)絡(luò),研究人員去掉了額外的預(yù)處理步驟,并創(chuàng)建了一種理想的方案,使用常規(guī)獲取的圖像就能輕松地將其轉(zhuǎn)換為臨床護理。
下一步,馬爾吉安的團隊將在更大的數(shù)據(jù)集上測試其深度學(xué)習(xí)模型,以進行進一步的驗證,然后再決定是否將該技術(shù)應(yīng)用到臨床中。
同時,研究人員希望通過正在進行的國家臨床試驗來開發(fā)抑制IDH的藥物。如果有效,這些抑制劑可以與AI影像技術(shù)結(jié)合,有望徹底改變某些腦瘤的檢測和治療方法。
未來,使用AI來檢測IDH突變的膠質(zhì)瘤,然后使用IDH抑制劑來減慢或逆轉(zhuǎn)腫瘤的生長,可能無需手術(shù)就可以治療某些特定的膠質(zhì)瘤。
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