科學家發(fā)現(xiàn)了一種吸引了“緊急關注”的新冠病毒突變,因為它使該病毒更具傳染性,并且已經(jīng)在其到達的地方(包括美國的部分地區(qū))占主導地位。
研究表明,使冠狀病毒更具傳染性的突變株已經(jīng)“統(tǒng)治”(dominant)了美國和歐洲,而研發(fā)中的疫苗可能對它起不了足夠的“抵御”作用。
位于美國新墨西哥州的洛斯阿拉莫斯國家實驗室(LANL)的研究人員稱,該突變株于2月初開始在歐洲傳播。
自那以后,它就進入了美國,到3月,它已成為美國東海岸常見、具侵略性的菌株,科學家們說它現(xiàn)在是世界上主要的菌株。
圖1.GISAID提供的基于4,535個修剪的全基因組,制作出來的與新冠病毒形成比對的系統(tǒng)發(fā)育樹
圖2. 到3月份,在GISAID數(shù)據(jù)庫中采樣良好的每個區(qū)域中,帶有D614G突變的序列的比例都在增加。
在他們的報告中(尚未經(jīng)過同行評審,但已發(fā)布到BioRxiv上),研究人員警告說,美國目前正在開發(fā)的疫苗可能無法有效抵抗這種突變株,并敦促在進一步的工作中考慮對這些發(fā)現(xiàn)進行研究,以更好地應用在新冠治療和注射中。
一般來說,新冠病毒比一般病毒相對穩(wěn)定,這意味著它不會以極高的速率或速度進行變異。
但這并不是說它根本就沒有突變,或者說它會限制那些可能會帶來災難性后果的突變。
他們在此項分析中每天都會下載所有病毒基因組序列,并將其上傳至較大的國際數(shù)據(jù)庫——GISAID,并解釋病毒的變異方式和發(fā)生位置。
隨著研究進展,該團隊發(fā)現(xiàn)了14個突變。這種突變似乎使病毒表面的“刺突”蛋白更有能力攻擊人類細胞,并對我們的抗體反應更具抵抗力。
表1.總結了研究人員們在新冠病毒刺突中追蹤得到的相關突變。除了D614G,新冠刺突蛋白中的所有其他突變?nèi)匀缓苌僖?;盡管如此,他們?nèi)詫ζ溥M行潛在的免疫學監(jiān)測。
一些病毒很可能與社區(qū)隔離,并在他們追蹤的過程中,作為病毒基因組采樣方式的副產(chǎn)品而突然出現(xiàn)。
來自英國洛斯阿拉莫斯、杜克大學和謝菲爾德大學的合著科學家們寫道,與此同時——其他模式可能代表著更廣泛、更令人擔憂的傳播和變異。
目前,科學家們尚不清楚產(chǎn)生新冠病毒突變的“刺突”是否首先出現(xiàn)在中國或歐洲,但它無疑在歐洲聚集了勢頭,然后席卷了全球。
當科學家在今年3月份首次報告Spike D614G這種突變蛋白時,它在上傳到GISAID的序列中只出現(xiàn)了七次(比實時延遲了大約兩周)。
研究人員在4月30日在線發(fā)布的報告中寫道:“不過,從4月初開始,對GISAID數(shù)據(jù)的采樣顯示,G614的頻率在整個3月份以驚人的速度增長,而且顯然表明其地域分布正在不斷擴大?!?/span>
似乎在某個時候,G614突變和另一個D614突變合并成為了D614G突變。它們共同成為主導,并通過多種模式變得更具感染力。在這之后,刺突蛋白具有更高的感染力,可以更容易地與人肺細胞上的受體結合,變得更有活性,甚至可能更容易躲開人體對病毒產(chǎn)生的抗體。
圖3.連續(xù)每周平均計數(shù)顯示了世界不同區(qū)域中D614(橙色)和G614(藍色)的相對數(shù)量。
研究作者寫道:“鑒于刺突蛋白在病毒感染性和作為抗體靶標方面都至關重要,我們迫切需要建立一個‘預警’管道以評估這種刺突突變中新冠大流行的演變?!?/span>
如果大流行未能減弱,這可能會加劇抗原漂移的可能性,以及在人群中免疫學相關突變的積累,這些人接種一針疫苗需要一年或更長時間。
研究人員警告說,開發(fā)中的疫苗可能沒有考慮到這種情況,因而這些疫苗對目前占主導地位的菌株產(chǎn)生的效力可能會降低,達不到期望的效果:“這種情況是合理的,現(xiàn)在通過承擔這種風險,我們或許可以避免錯過病毒中重要的進化突變,如果忽視這些突變,可能會抑制首批疫苗在臨床上的有效性。”
這種突變的發(fā)現(xiàn),可能會在各國近來啟動的許多疫苗、藥物臨床試驗(包括來自Moderna、Inovio和Pfizer等企業(yè)和機構的試驗)中發(fā)揮作用。
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