倫敦大學(xué)新研究揭示：去年10月新冠病毒已開始傳播
根據(jù)世衛(wèi)組織實(shí)時統(tǒng)計數(shù)據(jù)，全球確診新冠肺炎（COVID-19）病例超376萬，死亡病例近26萬。新型冠狀病毒（SARS-CoV-2）仍在繼續(xù)傳播，然而關(guān)于病毒早出現(xiàn)的時間，目前仍無定論。
5月6日，由倫敦大學(xué)學(xué)院遺傳學(xué)研究所的研究人員領(lǐng)銜帶來的一項(xiàng)研究報告顯示，SARS-CoV-2早可能在2019年10月已經(jīng)從中間宿主跳到人類，并且由此引發(fā)的全球大流行在2019年12月底已經(jīng)開始。該報告以預(yù)校稿的形式在線發(fā)布于國際醫(yī)學(xué)期刊《Infection, Genetics and Evolution》上。
這份報告提出的觀點(diǎn)與三天前發(fā)布在《International Journal of Antimicrobial Agents》上的短篇通訊論文不謀而合，后者通過一名去年年底出現(xiàn)流感樣疾病的法國患者實(shí)際上感染了SARS-CoV-2的事例，推斷出SARS-CoV-2可能早就已經(jīng)在全球范圍內(nèi)傳播。
自2020年1月份一個SARS-CoV-2基因組序列發(fā)布以來，目前全世界已經(jīng)有成千上萬個共享的病毒基因組序列。
截至4月19日，倫敦大學(xué)學(xué)院遺傳學(xué)研究所的研究人員從“全球流感數(shù)據(jù)共享計劃（GISAID）”數(shù)據(jù)庫下載了7710病毒基因組數(shù)據(jù)，經(jīng)篩選后，使用其中7666個基因組數(shù)據(jù)組成了數(shù)據(jù)集，并使用遺傳進(jìn)化樹描述了這些病毒基因組的進(jìn)化與采集時間之間的關(guān)系。
病毒基因組數(shù)據(jù)來源地、分析時間以及遺傳進(jìn)化樹
通過TreeDater軟件，研究人員估計原始病毒于2019年10月6日至2019年12月11日期間出現(xiàn)，也就是說，病毒可能早在去年10月份就已經(jīng)開始在人群中傳播。這與COVID-19流行的初時間相對應(yīng)。
該報告的通訊作者、倫敦大學(xué)學(xué)院遺傳學(xué)研究所的Fran?ois Balloux說：“這排除了SARS-CoV-2在被發(fā)現(xiàn)之前的很長一段時間里就已經(jīng)在傳播并感染了大部分人的假設(shè)。”
在進(jìn)一步分析中，研究人員發(fā)現(xiàn)，來自英國、美國、冰島、澳大利亞等大多數(shù)國家的SARS-CoV-2基因組多樣性基本概括了7666個基因組數(shù)據(jù)集中COVID-19的全球多樣性，這說明這些本地流行病都是通過大量獨(dú)立的病毒基因組傳播而引起的。
隨后，研究人員確認(rèn)這些病毒基因組中存在198個復(fù)發(fā)突變（recurrent mutations），其中將近80％的復(fù)發(fā)突變在蛋白質(zhì)水平上產(chǎn)生了非同義的變化，說明病毒可能還在持續(xù)進(jìn)化以適應(yīng)新的人類宿主。
Balloux認(rèn)為，任何試圖找到“零號患者”的努力都是徒勞的，因?yàn)椴《編缀酢盁o處不在”，存在太多的“零號患者”。
在文章的后，研究人員提到，重要的是以這種方式繼續(xù)監(jiān)視SARS-CoV-2的演變并將結(jié)果提供給學(xué)界，這對于識別SARS-CoV-2中出現(xiàn)和傳播的關(guān)鍵復(fù)發(fā)突變大有裨益，對于疫苗和藥物的研發(fā)也至關(guān)重要。
參考資料：
[1] Emergence of genomic diversity and recurrent mutations in SARS-CoV-2.
[2] Coronavirus quickly spread around the world starting late last year, new genetic analysis shows.
[3]英國研究：新冠早始于去年十月，“所有國家?guī)缀跬瑫r傳播”.
[4]SARS-CoV-2 was already spreading in France in late December 2019.
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