我院的前身是1922年成立的远近闻名的吴满福跌打医馆，50年代公私合营由多家私人诊所合并成集体所有制联合诊所，随后先后易名为普君医院、朝东卫生院、朝东医院；1972年正式挂牌成为公有制的佛山市人民医院，1982年更名为佛山市第一人民医院，1983年地、市行政区域合并后，又更名为佛山市第二人民医院，至今已有93年的历史。
      1991年通过评审成为全国首批二级甲等综合医院；2000年通过全国高等医学教学医院的评审，内、外、妇、儿、眼、耳鼻喉、麻醉等科室成为广东省临床住院医师规范化培训基地；2003年由市政府下文增挂“佛山市便民医院”，赋予承担低保病人的救治任务；2010年11月，获国家人力资源和社会保障部批准设立博士后科研工作站；2010年12月，以较优良的成绩顺利通过高等医学院校非直属附属医院的评审，成为南方医科大学附属佛山医院；2011年7月，评审通过成为三级甲等综合医院。 
      医院目前占地面积23000平方米，医疗建筑用房51000平方米。编制床位838张。全院现有工作人员1261人，其中专业技术人员1008人，正高职称61人，副高职称124人，初中级职称846人，博士16人，硕士99人。设职能科室17个，临床科室47个（其中一级临床科室18个，二级临床科室29个）、医技科室15个。科室设置合理齐全，专科建设各具特色。近年来，医院的总体规模、水平、效益均取得了令人瞩目的成绩，实现了跨越式发展。2014年门急诊人次194.7万，出院人次3.97万。 
      医院设备先进、齐全，目前拥有万元以上医疗设备共1254台，设备总价值达2.77亿多元，包括GE 16层螺旋CT、 GE 1.5T双梯度核磁共振系统、GE直接数字化X线摄影系统DR、西门子直接数字化X线摄影系统（DR）、移动式X射线摄影系统（移动DR）、全数字乳腺X射线机（钼靶）、双能X线全身骨密度仪、美国GE Innova 3100-IQ数字化平板血管造影机(DSA)、高等菲利普IE33实时三维心脏彩色多普勒超声诊断仪、高等菲利普iUElite全身多功能彩色多普勒超声诊断仪、高等美国GE彩色多普勒四维超声诊断仪、高等便携式心脏彩超、高等大型全自动生化分析仪、法国梅里埃全自动微生物鉴定分析系统、日本希森美康全自动血液分析流水线系统、全自动化学发光免疫分析仪、全自动流式细胞仪、全自动免疫组化染色系统、数字遥测心电监护系统、史托克ＳⅢ人工心肺机、日本奥林巴斯高清晰电子腹腔镜及宫腔镜系统、德国史赛克HD 1288高清晰腹腔镜系统、日本奥林巴斯高清电子鼻咽喉镜、电子胸腔内窥镜、前庭功能检测仪、听觉诱发电位仪、德国鹰视准分子激光治疗仪、光学相干断层扫描仪（OCT）、德国蔡司多波长激光仪、德国蔡司眼前节联合分析仪、眼科广域数字小儿眼底成像系统（RetCam 3）、海德堡共焦激光造影光学相干断层扫描仪一体机、德国罗兰电生理传统多焦一体机、以色列飞顿半导体脱毛激光治疗仪、体腔热灌注治疗系统、全自动药片分包机系统等一大批国际前列的医疗设备。 
      医院坚持“科技兴院”的发展方针，实施重点学科建设战略。目前我院拥有10个省市级重点（特色）专科：2012年11月“耳鼻咽喉科”首次获得广东省临床重点专科，是耳鼻咽喉科继2012年3月被列为广东省中医药局“十二五”重点专科建设单位后，再次被评选为省级重点专科，也是佛山市首批特色专科，2012年5月“中医耳鼻咽喉科学”入围国家中医药管理局“十二五中医药重点学科”遴选；眼科2013年7月成为广东省临床重点专科，2012年1月入围国家重点专科遴选，也是佛山市首批重点专科；口腔科2013年7月成为广东省临床重点专科，也是佛山市“十二五”特色专科；心内科为佛山市首批特色专科；检验科为“十二五”佛山市特色专科。同时，启动了首批院级重点专科建设：经过严格评审，新药临床试验基地建设专项（GCP）、普外微创中心、内镜诊疗中心被列为院级重点专科，无创血管成像、妇科微创、运动损伤与关节镜、消毒供应护理、血管介入护理、眼科护理、外科综合护理被列为院级特色专科，睡眠呼吸疾病、痤疮被列为院级特色专病。 
      眼科中心是我院重点打造的专科，为广东省临床重点专科、佛山市首批重点专科。现有医疗用房5500m2，拥有病床100张，手术室5间，眼科医护人员86人，现有眼科主任医师7人，副主任医师7人；其中有硕士生导师1人，有眼科学博士6人，硕士17人。下设10个临床科室即白内障科、眼底病科、角膜病科、眼外伤科、青光眼科、泪道病科、视光学科、准分子激光科、眼肌病科及眼科特殊检查科。佛山市防盲办公室、佛山市低视力康复指导站及佛山市眼科研究所也设于我院眼科。其中白内障、眼底病、眼外伤、角膜病、准分子激光为我院眼科强势专业，近两年开展了泪道病的内窥镜微创治疗，广域视网膜成像系统早产儿视网膜病变筛查，3D视觉训练治疗等国际先进的检查和治疗方法。同时承担省级课题2项，市科持局课题10多项。眼科中心以技术精良、设备先进闻名于省内外，在珠江三角洲地区享有很高的声誉。每年的门诊量超过16万人次，手术量达到6000多台次，在省内眼科名列前茅，同时在国内眼科界也具有很高的知名度，不少港澳同胞及省外患者慕名前来就诊。 
      心脏中心为佛山市首批市级特色专科，也是我院重点专科，下设心脏综合病区（CCU、心脏介入诊疗中心、心脏功能检查室）、心脏一科、心脏二科、心脏三科、心脏外科、心电图室及心脏中心专科门诊，现拥有病床200多张，具有国内优异的先进设备和雄厚的技术力量。开展高血压、冠心病、心律失常、心力衰竭、主动脉夹层、结构性心脏病等临床诊疗，而冠心病的急性冠脉综合征的血管成形术、心律失常的射频消融术、安装持久起搏器、ICD、CRT术以及主动脉瘤大支架隔绝术等心脏介入治疗是该科的特色，“急性心肌梗死绿色通道”的开展挽救了不少本市及周边地区心脏病患者的生命，在低龄复杂小儿先心病、老年重症风湿性瓣膜病变等手术治疗方面也取得了良好的成效。 
      耳鼻咽喉科为广东省临床重点专科，广东省中医药局重点专科，佛山市中西医结合耳鼻咽喉特色专科。 目前科室承担南方医科大学、广东医学院、遵义医学院等临床教学工作；科室有硕士研究生导师1名，未来三年争取获得2-3名硕士研究生导师资格及广东省耳鼻喉科继续教育基地资格。 在科研方面曾获国家自然科学基金项目2项（目前在研1项），广东省卫生厅科研项目6项，广东省中医药局科研课题6项，佛山市科技局科技发展专项基金6项，佛山市卫生局科研课题6项，获广东省科学技术奖励三等奖1项，佛山市科技进步二等奖4项，湖南省中医药科技奖二等奖1项，目前在研科研经费160万元。曾被佛山市政府授予《先进科技集体》光荣称号。 
      口腔科为广东省临床重点专科、佛山市特色专科。多年来秉承“在创新中求发展”的思路，从小到大，从弱到强。从当年综合医院中默默无闻的小科，发展成为现在的广东省临床重点专科和佛山市特色专科，在省、内外同行和国内、外患者中享有广泛的影响。该中心获得2项国家专利，6项省级、8项市级科研课题，7项省、市级科研成果，出版2部著作，在国内、外专业杂志上发表100多篇论文。该中心的三大技术特色：牙周病晚期重度松动牙的保留修复、各类残根牙的保留修复；感染牙的即刻种植技术；成人牙周病的正畸治疗、各种疑难正畸矫治、自创铸造式III类磁力功能矫治器等。 
      检验科是“广东省卫生系统青年文明号”、“佛山市工人先锋号”,现有检验人员36名，其中高级职称5名，主任技师2名，副主任技师3名。日常检验工作已完全标准化和信息化，确保了检验报告快速和准确。一些诊断技术及工作模式居国内先进水平，包括血栓分子标志物检测，心肺功能实验室检测，自身免疫病的实验室检查，疾病的基因诊断，检验前和检验后工作实现了 “临床化”。 
      “十一五”期间，医院共获科研课题107项，其中省部级1项，市级重点7项，厅市级62项；市级科技成果奖励共20项。出版专著5部，发表学术论文568篇，其中SCI 2篇，中文核心140篇，科技核心76篇，一般期刊351篇。近十年共获得科研经费156.8万元。 
      “十二五”开局之年，我院以南方医科大学为依托，首次获得国家自然科学基金课题1项，获得资助经费57万元，居市直医院课题经费支持额度之首，实现了我院课题“零”的突破；并与南方医科大学合作，以院长李蜀光博士后为项目负责人，成功申报佛山市产学研项目“重大疾病(恶性肿瘤）分子分型和个体化诊疗创新平台建设及产品开发研究”，获得经费20万元；同时获得科技厅立项2项，获经费6万元。我院2011年度获得立项的国家自然科学基金、广东省科技厅、广东省卫生厅、广东省中医药局、佛山市科技局等总计立项课题30项，科研经费共91万元，超过前10年科研经费总和的一半；同时，2011年获得佛山市科学技术奖励一等奖1项，二等奖1项，三等奖1项。 
      承接“十二五”开局之年的良好势头，2012年为了加强“科技兴院、科技强院”，鼓励科技创新，2012年7月隆重召开了2010-2011年度科教奖励大会：重奖在2010-2011年间科教工作作出突出贡献的213名科技人员，奖励金额达93万多元；2012年首次获得广东省自然科学基金项目2项，是继我院2011年获得1项国家自然科学基金后，实现广东省自然科学基金项目“零”的突破；全院发表学术论文141篇，其中SCI论文2篇，中文核心期刊32篇，科技核心期刊51篇；获各级科学技术奖励2项，其中佛山市科学技术奖励贰等奖1项、贰等奖2项，叁等奖1项。2012年我院启动了“人才强院”工程，以省级继续医学教育项目为依托，以90周年院庆为载体，成功举办了几个有影响力的学术或管理论坛：如“粤港澳眼科学术论坛暨90周年院庆眼科学术会议”、“公立医院改革高峰论坛”、“国际口腔学术论坛”、“佛山市医保政策与医保管理论坛”、“2012年广东省医院管理（佛山）论坛”； 实施副高以上人员的“二次培养计划”，外派副高以上人员外出进修20多人；与中山大学签订第三方委托培养协议，率先将“住院医师规范化培训”引入第三方培养与考核，提升培训质量。2012年全院获得南方医科大学、广东医学院、广东药学院硕士研究生导师10名，参与高层次人才培养。
      2013年课题申报获得新的突破，获得中国博士后博士启动项目1项，资助经费8万元；获得广东省自然科学基金项目1项，资助经费5万元,总计获立项课题41项，获得总经费94万元。2013年全院发表学术论文144篇，其中SCI论文3篇，中文核心期刊36篇，统计源期刊41篇。
      2013年7月在佛山市率先成立了“技能培训中心”并投入使用，自成立以来，进行了全院1200余人全员参加的急救技能竞赛；完成了住院医师规范化培训结业考核；中心承担在我院的实习生、进修生、新入职医护人员的各类日常技能培训与考核工作。2014年6月，经考核，佛山市第二人民医院美国心脏协会心血管急救培训中心正式挂牌成立。中心面向社会招生，普及急救知识与技能，考核合格者颁发国际通用的证书。2014年下半年，已为300余名全市专业技术人员和社会公众提供技能培训与考核。护理技能培训室每周都有新入职护士的操作培训，为新护士的快速成长提供支持和保障。在医院临床一线人手紧张的情况下，适时地提出了“人才强院”战略，为选拔学科高层次人才，建设优异学科梯队，今年启动了我院首届“优异青年人才遴选”，经过初筛与答辩，遴选出10名优异后备人才，并分批送至上级医院进修学习。2014年，为拓宽临床科室主任的管理视野，我院启动临床科室主要管理人员赴华西医院短期观摩学习工作。截止到年底，共计派出25名临床管理干部赴华西。
      （一）优质服务工程 
      医院自08年开始在全院全面开展“创优质服务品牌”活动。几年来，通过美化服务环境，改善服务设施，强化服务培训，规范服务行为，创新服务模式，优化服务流程，完善服务制度，规范服务管理，加强服务质量的监控，持续改进服务质量，打造了具有特色的服务文化。舒适的就医环境、精湛的医疗技术、规范的诊疗行为、优质的医疗服务赢得了广大患者和社会各界的肯定和认可。2010、2012年，在佛山市卫生局连续两次组织的“佛山市市属8家医院外部客户满意度调查”中，我院两年均以排名前列的佳绩摘得医院综合服务满意度桂冠，是市直医院中少有门急诊满意度达到满意的医院。 
      （二）信息化建设工程 
      从2003年起，医院按照“超前领导，总体规划，分步实施，建设以病人信息为主线的医疗信息资源一体化平台”的建设目标，经过多年的不懈努力，目前已建成的医疗信息资源平台有：门急诊管理系统、住院管理系统、电子病历、检验系统、影像管理系统、药品管理系统、医技管理系统、手术麻醉系统、ICU危重监护系统、办公自动化系统、成本核算系统、管理（药品）监控系统等二十多个功能模块。初具规模的局域网络和数据中心，实现了医疗业务流程的信息化支撑，积累了大量诊疗业务信息，使医院率先在佛山上传较全面的区域卫生平台数据，完成了市民健康卡业务试点。医院信息化的建设和使用，大大简化和优化了服务流程，使数字化医院建设初见成效，被选定为佛山市信息化试点单位，在2012年进行了国家居民健康卡初次应用，积极开展了带金融功能居民健康卡的推广应用，在国内取得了较高的声誉，连续接待了国家卫生计生委、广东省卫生计生委卫生厅及上海市、四川省南充市、湖南省娄底市等多家单位来我院参观和指导。
      1、2010年8月获中华人民共和国人力资源和社会保障部批准成立博士后科研工作站；2013年1月获卫生部医药生物工程技术研究中心批准成立佛山临床研究基地；佛山市临床医药研究中心、佛山市企业博士后站临床综合实验室、佛山市眼科研究所、佛山市防盲办公室、佛山市低视力康复指导站、广东医学院硕士研究生联合培养基地、广东省创伤救治科研中心创伤骨科、中国康复医学会广东修复重建委员会等均设在我院； 
      2、2008年、2009年、2010、2011、2012、2013年连续六年获得“市直医疗卫生单位综合目标管理责任制考评先进单位”的殊荣； 
      3、2010、2012年在佛山市卫生局组织的“佛山市市属8家医院外部客户满意度调查”中，均以一位的成绩获得“服务满意度优异奖”； 
      4、2010年10月，荣获“佛山市扶贫工作先进单位”称号；
      5、2011年1月，荣获“扶贫双到和卫生帮扶工作特别贡献奖”；
      6、2012年6月，荣获“广东省护理学会举办的护理用具比赛”二等奖1项，优胜奖4项；
      7、2012年8月，分别荣获“2012年佛山市女职工医疗护理岗位创新技能大赛”二、三等奖； 
      8、2012年8月，荣获“2012年广东省女职工医疗护理岗位创新技能大赛”二等奖。 
      9、2012年在佛山市卫生局组织的市直医疗卫生单位综合目标管理责任制考评中获得“三基”考核医疗类第二名、护理类一位的好成绩；其中我院何远琴医生还荣获医疗类全市一位的殊荣。 
      10、2012年荣获广东省“全省流感监测管理综合评定一位”。 
      11、2012年荣获佛山市“传染病管理先进单位”。 
      12、2013年荣获广东省委、省政府办公厅联合颁发 “扶贫工作优异单位”称号。
      13、2014年荣获“南方医科大学临床教师教学能力竞赛二等奖”。